发布日期:2026-07-29 10:12:03 生物制药发酵是药物原料生产的核心环节,发酵体系内微生物代谢活动持续变化,各类工艺参数相互耦合,工艺调控难度较高。长期以来,行业普遍依靠离线取样检测获取发酵状态信息,数据存在明显滞后性,难以及时捕捉代谢波动,制约工艺参数持续优化。
过程分析技术体系不断完善,鉴知在线拉曼监测方案逐步应用于生物制药发酵场景。在线拉曼设备能够原位、连续采集发酵液光谱信息,经过标准化解析后输出营养底物、代谢副产物、目标产物、生物量等多项指标。
连续、同步、实时的数据集,为系统性调整发酵温度、pH、补料策略、通气与搅拌等关键工艺参数提供可靠支撑。合理挖掘、运用在线拉曼监测数据,能够持续缩小工艺波动区间,稳定发酵过程状态,推进生物制药发酵工艺规范化、数字化升级。

(一)传统发酵监测模式存在的局限
1. 数据获取存在时间滞后
离线检测需要完成取样、样品前处理、实验室分析整套流程,从发酵体系取样到获取检测结果存在较长间隔。发酵过程微生物代谢持续变化,滞后的数据无法实时反映当下菌体代谢状态,参数调整往往存在滞后,容易错过最佳调控窗口。
2. 取样操作带来多重风险
离线取样需要打破发酵罐密闭运行环境,外部污染物存在进入发酵体系的可能性,提升染菌风险。频繁取样也会持续消耗发酵液,改变罐体体积、物料浓度,对发酵体系稳态形成干扰。
3. 检测指标分散,难以构建关联关系
传统检测手段大多单次仅能测定单一指标,不同指标检测时间无法完全同步,不同批次数据匹配难度较大。工艺人员难以同步掌握底物消耗、产物合成、副产物积累之间的动态关联,不利于厘清各项工艺参数对于代谢路径的影响规律。
4. 工艺优化依靠经验支撑
缺少全过程连续的代谢数据支撑,工艺优化多依靠操作人员积累的经验开展,参数调整试错周期较长。不同批次之间的细微代谢差异难以被完整捕捉,不利于系统性识别工艺波动根源,稳定工艺空间的构建进程较为缓慢。
(二)鉴知在线拉曼监测技术适配发酵场景的核心优势
1. 原位无损连续监测
鉴知RS2100在线拉曼分析仪配套浸入式光学探头,可通过发酵罐标准接口安装,探头能够耐受标准灭菌条件,可随同罐体完成湿热灭菌。监测过程无需抽取发酵样品,不破坏发酵密闭环境,持续降低污染风险,同时不会改变发酵体系原有组分状态。设备能够全天候不间断采集光谱数据,形成完整连续的发酵过程数据流。
2. 单套设备实现多参数同步监测
基于分子拉曼散射原理,发酵液内各类物质拥有专属特征光谱信号。设备单次光谱采集,可同步采集多种营养底物、代谢产物、副产物对应的光谱信息,经过化学计量学模型解析后,同步输出多项关键指标。同步采集的数据具备统一时间戳,便于后续开展多指标关联性分析。
3. 水环境干扰程度较低
发酵体系以水溶液为基质,水分子拉曼信号强度偏低,对目标物质光谱信号干扰有限。该特性让鉴知在线拉曼设备可以稳定适配高含水发酵液原位检测场景,保障复杂液相环境下光谱信号的有效性。
4. 具备标准化数据输出能力
设备搭载通用数据传输接口,采集的原始光谱、解析后的工艺指标数据可以标准化输出,能够对接车间工控系统、数据存储平台,便于实现数据长期归档、批量调取,支撑工艺长期迭代优化。
(一)硬件系统选型与现场部署
1. 设备机型匹配不同发酵场景
鉴知在线拉曼分析仪拥有不同通道配置机型,工艺研发阶段单罐小试、中试场景,可选用单通道机型,对应单一发酵罐开展全过程数据采集。多条生产线并行、多罐体同步发酵的规模化生产场景,可以选用多通道机型,单台主机分时连接多路光学探头,同时采集多个发酵罐光谱数据,优化硬件配置投入。
光学探头规格可结合发酵罐容积、罐体接口规格、灭菌条件进行匹配,保障探头浸入深度合理,避开搅拌桨、消泡装置等部件,避免机械摩擦损伤探头光学窗口。
2. 现场环境适配优化
发酵车间存在震动、温度波动、水汽等环境条件,设备主机可安置在车间防爆机柜内部,做好温湿度调控。光纤线缆做好防护布置,避免长期弯折、外力挤压。设备安装完成后,按照规范完成光路校验,保障长期运行时光谱采集稳定性。
3. 信号链路搭建
探头采集的散射光信号通过光纤传输至光谱分析主机,主机完成光谱原始数据预处理,依托内置算法模块完成基线校正、噪声剔除等基础操作。处理后的光谱数据与解析后的浓度指标,通过通信协议上传至数据管理平台或者分布式控制系统。
(二)标准化数据采集流程构建
1. 确定光谱采集周期
采集周期需要结合发酵阶段代谢速率进行设置。发酵前期菌体生长速度平缓,可适度拉长采集间隔;对数生长期、产物合成稳定期菌体代谢活跃,缩短光谱采集周期,保证完整捕捉代谢变化趋势。采集周期设置完成后全程保持统一,保障不同阶段数据具备一致性。
2. 同步关联基础工艺参数
在线拉曼获取的代谢光谱数据,需要与发酵罐自带传感器采集的温度、搅拌转速、通气量、pH、溶氧等参数建立时间同步关系。统一时间戳是后续开展参数关联性分析、构建工艺优化模型的基础。所有数据同步归档,形成完整发酵批次数据集。
3. 建立异常光谱识别机制
发酵过程中气泡、菌体浓度骤变、探头光学窗口附着菌体沉淀等情况,会带来光谱信号扰动。依托鉴知设备内置的数据预处理模块,自动识别异常光谱信号并进行标记,在后续数据分析阶段剔除无效数据,避免异常数据干扰工艺分析结论。
(一)样本数据集搭建
定量模型是将原始拉曼光谱转化为代谢组分浓度信息的核心载体。模型构建阶段,需要开展多批次发酵试验,在采集在线拉曼光谱的同步时间点,完成离线取样检测,获取对应时间点各组分参考数值,形成光谱-参考数值配对数据集。
数据集需要覆盖发酵全过程不同阶段,同时纳入不同工艺参数条件下的样本,覆盖工艺正常波动区间,提升模型在不同工况下的适用性。全部配对样本完成时间对齐,剔除标记完成的异常光谱样本,形成标准化训练数据集。
(二)光谱预处理与变量筛选
原始拉曼光谱包含基线漂移、随机噪声、散射干扰等无关信息,需要开展标准化预处理。预处理操作包含基线校正、光谱归一化、微分处理等操作,降低非目标因素带来的信号波动。
完成预处理之后,筛选与发酵关键组分相关的特征光谱区间,剔除无效光谱波段,减少无关变量干扰,提升模型运算效率与稳定性。该环节依托鉴知设备配套数据分析软件完成标准化操作流程。
(三)化学计量学模型训练与验证
采用多元回归算法搭建定量预测模型,建立光谱特征信号与底物、产物、副产物浓度之间的数学关联。数据集划分为训练集与验证集,使用训练集完成模型训练,再利用独立验证数据集检验模型预测效果。
根据验证结果调整预处理方式、特征波段范围,持续优化模型表现。模型达到预期标准后完成固化,部署至在线拉曼分析系统,发酵运行阶段仪器便可实时解析光谱数据,输出各项代谢指标。
模型投入现场使用之后,需要持续收集新批次发酵数据,定期开展模型维护更新。随着发酵培养基、菌种、工艺策略微调,持续扩充样本数据集,维持模型长期预测稳定性。
(一)发酵不同阶段代谢特征的数据解读
生物制药发酵流程可以划分为适应期、对数生长期、产物合成稳定期、菌体衰亡期,在线拉曼连续光谱数据能够清晰呈现各个阶段代谢转换特征。
1. 发酵适应期
菌种接入发酵罐后,菌体逐步适应培养环境,底物消耗速率维持较低水平。通过拉曼数据持续观察营养底物消耗趋势,判断菌种适应进度。若底物长期消耗缓慢,代表菌种活性偏弱,可以结合数据评估是否微调初始培养条件,为后续菌体增殖创造条件。
2. 对数生长期
菌体快速增殖,碳源、氮源消耗速率持续上升,生物量相关光谱信号持续增强。此阶段拉曼数据能够直观呈现底物消耗速率变化趋势,以此评估温度、溶氧、搅拌参数对于菌体生长速率带来的影响,寻找适配菌种增殖的参数区间。
3. 产物合成稳定期
菌体增殖速度放缓,代谢重心转向目标产物合成,副产物积累趋势成为重要观测指标。在线拉曼数据同步追踪产物生成速率与有机酸等副产物变化,用来判断各项工艺参数是否有利于维持产物合成代谢通路,抑制副代谢路径运行。
4. 菌体衰亡期
底物持续消耗至较低水平,产物合成速率下降,菌体逐步衰老。光谱信号变化能够辅助判断衰亡起始节点,为确定发酵终点、优化放罐时机提供数据依据。
(二)解析关键工艺参数对于代谢状态的影响
发酵核心可控工艺参数包含培养温度、pH、搅拌转速、通气量、补料策略。各项参数相互耦合,共同影响菌体代谢路径。依靠连续在线拉曼数据集,可以系统性开展参数影响规律分析。
1. 温度参数影响分析
不同温度区间会改变菌体代谢酶活性,影响底物消耗速度、产物合成效率。对比不同温度条件下多批次拉曼代谢数据,观察产物积累速率、副产物生成水平,确定适配产物合成的温度区间,区分适合菌体生长阶段与产物合成阶段的温度条件,探索分段温控策略。
2. pH参数影响分析
体系酸碱度直接调控微生物胞内代谢平衡。通过拉曼数据观测不同pH条件下有机酸、氨类代谢物变化,识别pH波动如何改变代谢流向,确定合适的pH控制区间,降低酸性副产物大量累积带来的抑制作用。
3. 搅拌与通气参数影响分析
搅拌转速与通气量共同决定发酵液溶氧水平,供氧不足容易诱发厌氧代谢路径,促使副产物生成。结合拉曼监测得到的底物消耗、副产物变化数据,评估不同搅拌、通气组合方案下的代谢表现,在满足供氧需求的前提下,兼顾搅拌剪切力对菌体的影响。
4. 补料策略优化分析
补料时机、补料速率、补料物料配比是发酵优化重点。在线拉曼可以实时反馈底物剩余浓度,直观呈现底物过量或者底物匮乏带来的代谢变化。对比不同补料方案对应的全过程代谢曲线,持续优化补料启动节点、持续补料流量,避免底物抑制或者营养饥饿。
(三)识别工艺异常对应的光谱特征规律
发酵过程染菌、底物供给失衡、代谢路径异常偏移,都会在拉曼光谱信号上体现出特异性变化。持续积累正常发酵批次光谱基线数据,建立正常代谢状态光谱参考区间。
当实时光谱特征持续偏离参考区间,系统可及时发出预警。工艺人员能够在代谢失衡早期开展干预,同时记录异常工况对应的光谱特征,不断完善异常识别标准,降低异常工况持续运行带来的损失。长期汇总异常批次数据,反向排查工艺参数设置缺陷,从源头减少同类异常重复出现。
(一)基于数据划定工艺设计空间
质量源于设计理念在生物制药发酵领域持续落地,工艺设计空间界定了能够保障发酵过程稳定、产物质量合格的工艺参数区间。传统方式依靠大量离线试验摸索区间边界,试验周期较长。
鉴知在线拉曼系统提供的全过程连续代谢数据,能够丰富工艺试验的数据维度。在试验设计框架下,设置多组梯度工艺参数开展发酵试验,完整采集各组试验全程光谱与代谢指标。通过对比不同参数条件下产物合成、副产物积累、菌体生长状态,确定各项工艺参数合理波动范围,搭建工艺设计空间。
工艺设计空间建立之后,所有生产操作参数控制在空间区间内,减少大幅度参数调整带来的工艺波动。后续新批次发酵数据持续纳入分析,持续校验设计空间边界,动态完善区间范围。
(二)分批补料策略的数据化优化
补料工艺是生物制药发酵参数优化的重点内容,传统脉冲式补料容易造成底物浓度大幅起伏,诱发代谢波动。依托在线拉曼实时底物浓度数据,推动补料模式由间歇脉冲补料向连续动态补料转变。
借助连续底物浓度曲线,确定底物浓度控制目标区间。当监测数据显示底物浓度接近区间下限,稳步提升补料流量;底物浓度持续走高时,适度下调补料速率,避免底物过量积累。持续多批次运行后,汇总拉曼数据集,分析不同底物稳态水平对应的产物表现,确定最优底物控制设定值。
同时,拉曼数据可以同步观测补料之后副产物变化,评估补料物料碳氮配比是否合理,根据代谢变化调整补料培养基组分,优化营养供给结构。
(三)构建分阶段分段式参数调控方案
菌体生长阶段与产物合成阶段的代谢需求存在明显区别,单一固定参数方案难以同时适配两个阶段。在线拉曼完整记录发酵全过程代谢演变节点,精准划分生长过渡期、代谢通路切换节点。
根据光谱数据识别的代谢切换时间点,设计分段调控策略。在菌体增殖阶段,参数设置优先保障生物量稳定增长;进入产物合成阶段之后,及时切换温度、pH、供氧、补料参数,引导代谢流向目标产物合成方向。依托多批次数据验证分段参数切换时机与参数设定值,不断优化阶段切换方案。
(四)缩小批次间工艺波动,提升工艺稳定性
不同发酵批次之间容易出现产物水平、代谢趋势差异,依靠离散的离线数据很难定位波动来源。在线拉曼提供全流程连续数据,能够对比不同批次全过程代谢曲线差异。
当批次结果出现偏差,回溯全过程拉曼代谢数据,定位代谢曲线出现分歧的时间节点,再对照同期温度、搅拌、补料等工艺操作记录,识别引发代谢波动的工艺参数。针对波动源头调整参数管控标准,收紧关键参数控制公差,逐步缩小批次之间的代谢差异,提升发酵工艺重现性。
(一)数据互通基础架构搭建
鉴知在线拉曼分析仪具备标准化通信接口,原始光谱数据、模型预测得出的代谢指标数据可以实时传输至发酵分布式控制系统。实现代谢监测数据与罐体基础传感器数据集中汇总,打破不同设备之间的数据孤岛。
数据传输链路设置数据校验机制,保障传输过程数据完整、时序准确,避免数据丢失、时序错乱影响调控逻辑运行。系统设置数据存储单元,长期保存所有批次光谱与工艺参数数据,满足工艺追溯、法规归档相关要求。
(二)建立基于实时拉曼数据的反馈调控逻辑
在完成定量模型验证、工艺区间确认之后,可以搭建基础闭环调控逻辑。以拉曼系统输出的底物浓度、副产物浓度作为反馈信号,联动补料泵、pH调节装置、通气控制系统执行自动调整。
调控逻辑设置合理的调节步长与延时机制,避免参数频繁大幅震荡。系统区分正常小幅波动与需要干预的显著偏离,防止频繁不必要调节扰乱发酵稳态。自动调控保留人工干预入口,出现特殊工况时工艺人员可手动接管参数控制。
(三)调控策略持续迭代优化
自动化闭环调控上线运行之后,持续收集每一批次调控过程数据、拉曼代谢曲线、最终发酵结果。汇总数据集分析现有调控逻辑存在的局限,优化参数调节触发阈值、调节幅度。
随着菌种改良、培养基配方调整,菌体代谢特征发生变化,调控策略也需要同步调整。依托在线拉曼积累的大量过程数据,持续更新调控规则,适配不断升级的发酵工艺体系。
(一)发酵全流程数据规范化管理
在线拉曼采集的原始光谱属于重要原始数据,需要按照制药行业数据管理规范进行存储。区分原始光谱文件、预处理光谱、模型预测指标、配套工艺操作参数,建立统一的数据命名规则与批次归档体系。
完善数据访问权限管理,记录数据查看、导出、修改操作轨迹,满足数据完整性相关要求。定期开展数据备份,防止存储介质故障造成历史数据丢失,保障工艺研发、生产数据可长期追溯。
(二)定量分析模型常态化维护
定量模型不是一次性构建完成后永久使用,发酵工艺任何调整都会改变体系基质条件,长时间运行之后模型预测偏差会逐步增大。建立模型定期评估机制,定期选取发酵样本,对比模型预测数值与离线参考检测结果,评估模型预测表现。
当偏差达到预设范围,扩充新批次样本数据集,重新开展模型训练优化。如果菌种、培养基出现较大调整,需要针对性开展专项试验,重构或者大范围更新定量模型,保障数据解析可靠性。
设备探头经过长期使用、多次灭菌之后,光学性能可能产生微小变化,按照设备维护规程定期开展光路校准,降低硬件漂移对光谱数据与模型稳定性带来的影响。
(三)契合生物制药行业监管相关要求
生物制药发酵工艺优化、在线监测系统应用需要遵循行业相关指导原则。鉴知在线拉曼整套监测系统、数据分析流程、模型构建流程,均可形成完整文件记录。
设备安装确认、运行确认、性能确认文件完整可追溯,模型构建、验证、更新过程形成标准化报告。所有基于拉曼数据开展的工艺参数调整,完整记录调整依据、试验过程、验证结果,形成工艺变更文件,支撑工艺变更相关评估工作。
(一)基质复杂带来的光谱信号干扰
发酵液含有菌体、蛋白、多种无机盐,复杂基质会带来荧光背景、光散射干扰,影响光谱质量。预处理算法可以对基线、荧光背景进行校正。同时优化探头安装位置,降低菌体团聚、大量气泡对光学窗口的干扰。持续优化样本数据集,提升模型抵抗基质波动的能力。
(二)模型泛化能力管控
小试发酵罐建立的定量模型,直接放大至中试、规模化发酵罐时,罐体混合条件、发酵液流体状态发生变化,容易带来预测偏差。推进工艺放大过程中,同步在各级罐体布置鉴知在线拉曼监测设备,逐级采集样本,扩充模型数据集,逐步提升模型跨规模适配能力。优先在同一规格罐体完成充分模型验证,再推进工艺规模放大。
(三)工艺人员数据分析能力匹配问题
完整发挥在线拉曼数据价值,需要工艺人员同时掌握发酵代谢知识与光谱数据分析基础。企业可以依托设备供应商配套的软件操作培训,建立内部标准化数据分析流程,形成固定的数据解读模板、工艺分析报告框架。依靠标准化流程降低数据分析门槛,逐步建立企业内部数据分析团队。
(四)长期运行运维管理体系搭建
在线拉曼设备需要持续投入运维管理。制定周期性维护计划,包含探头清洁、光路检查、设备除尘、通信链路检测等内容。记录每一次维护时间、维护内容,提前预判光学窗口污染、光纤老化等隐患,减少设备非正常停机,保障发酵全过程数据连续采集。
生物制药发酵工艺持续优化是长期系统性工作,传统依靠离散离线数据与经验调控的模式,难以支撑行业对于工艺稳定性、过程可控性不断提升的要求。鉴知在线拉曼监测方案通过原位连续采集发酵光谱数据,搭建起完整的数据获取、解析、分析、调控链路。
充分挖掘在线拉曼数据蕴含的代谢信息,能够帮助工艺人员清晰掌握工艺参数与菌体代谢之间的内在联系,科学划定工艺区间,优化补料、温度、溶氧等关键参数,逐步实现发酵过程数据驱动调控。随着持续的数据积累与模型迭代,在线拉曼技术将持续推动生物制药发酵工艺走向精细化、数字化管控,助力发酵生产过程稳定可控。